学校前身是1978年北京市依靠清华大学、北京大学、中国人民大学、北京师范大学等创办的36所大学分校。1985年，北京联合大学成立。1987年，北京市卫生职工学院中医部并入北京联合大学中医药学院。2001年，市教委同意北京联合大学化学工程学校和北京市化学工业集团职工大学划转给北京联合大学，北京市第一师范学校并入北京联合大学。2008年，北京市化工学校、北京市医药技术学校、北京市医药器械学校并入北京联合大学。
学校有1个主校区（北四环校区）、7个分校区，占地600余亩，总占地面积44.661万平方米，总建筑面积为53.459万平方米，教学、科研仪器设备资产总值10.396亿元；设有14个二级学院，开设70个本科专业，9个专科招生专业；全校教职工2599人，其中专任教师1463人，全日制在校生18698人。