放入冷冻虽然可以延长其保存时间，但是由于冷冻层的温度过低，山竹中的水汽会凝结成冰晶，破坏其组织结构，导致山竹的口感和风味改变，另外，山竹冷冻时间过长，其中的营养成分也会有所流失，因此一般建议山竹放冷藏保存更好。
一般情况下，热带水果是不能放在冰箱里贮存的，可山竹却不一样。虽然山竹果属于热带水果，但也可以储存在冰箱里。因为低温可以减少山竹水分的丧失，降低果胶酶的活性，延缓老化，所以山竹应该放在冰箱里冷藏。由于中国的山竹果一般是从国外进口或长途运输，一般市场上出售的不会是刚刚采摘的新鲜山竹果。虽然在储藏冰箱中可以在一定程度上减缓山竹的老化，但是山竹的新鲜度可以保持3-5天。如果使用科学的储存方法，山竹果可以储存10天左右。然而，山竹果的储存时间越长，味道和风味丧失和变质的速度就越慢。山竹极易变质，若想放得长一些，就一定要保证低温少氧。
此外，尽量密封，减少氧气的侵袭，也是保鲜的一个要诀。总的来说，把山竹装入保鲜袋中，留少量空气，再把袋口系紧，放进冰箱冷藏，就可以多放几天了。家庭贮藏时间不宜过长，建议一次不要大量购买。另外，山竹多吃会引起便秘，一般一天最多吃三个。