硬件组成的区别：
单片机是在一块集成电路芯片中包含了微控制器电路，集成到一块硅片上构成的一个小而完善的微型计算机系统，在工业控制领域的广泛应用。
嵌入式系统是可以用单片机实现，也可以用其它可编程的电子器件实现。
应用对象的区别：
嵌入式系统是软件和硬件的综合体，还可以涵盖机械等附属装置。适应应用系统对功能、可靠性、成本、体积、功耗等严格要求的专用计算机系统。
目前单片机渗透到我们生活的各个领域，几乎很难找到哪个领域没有单片机的踪迹。单片机广泛应用于仪器仪表、家用电器、医用设备、航空航天、专用设备的智能化管理及过程控制等领域。
嵌入式系统就是一个专用系统。专用系统中，可编程器件的软件可以在系统构建过程中植入，也可以在器件制造过程中直接生成，以降低制造成本。控制逻辑复杂的单片机会需要操作系统软件支持；控制逻辑简单的嵌入式系统也可以不用操作系统软件支持。